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Title: Enquête et étude des affections parasitaires et bactériennes dans la Wilaya de RELIZANE (2019-2025).
Authors: Etudiants: Belhouari nour el houda, Prof. DJELILATE Mohammed Abdia zahira
Keywords: الطفيليات المعوية; عدوى Enterobacteriaceae ; Blastocystis ; Klebsiellapneumoniae ; كوفيد- 19 ; النظافة; الوسط الداخلي; الأطفال; الظهور; غيليزان; الجزائر ; Parasitoses intestinales; infections à entérobactéries; Blastocystis; Klebsiellapneumoniae; COVID-19; hygiène; milieu interne; enfants; émergence; Relizane; Algérie ; Intestinal parasitosis; Enterobacteriaceae infections; Blastocystis; Klebsiellapneumoniae; COVID-19; hygiene; institutional setting; children; emergence; Relizane; Algeria.
Issue Date: 1-Jul-2026
Publisher: Département des Sciences Biologiques
Citation: Spécialité Parasitologie
Series/Report no.: ;13/2026
Abstract: الملخص أجُريت هذه الدراسة بأثر رجعي في مخبر مستشفوي بمنطقة غيليزان )الجزائر( بين عامي 2019 و 2025 بهدف تحليل ومقارنة تطور الالتهابات الطفيلية المعوية والالتهابات البكتيرية المعوية من نوع Enterobacteriaceae ، مع الأخذ بعين الاعتبار تأثير جائحة كوفيد- 19 . في مجال الطفيليات، تراوح معدل الانتشار الإجمالي بين 35 % و 51 %، مسجلاً أعلى مستوى له عند 51 % سنة 2023 وأدنى مستوى عند 38 % سنة 2020 خلال فترة التدابير الصحية المرتبطة بالجائحة. لوحظ انعكاس وبائي كبير ابتداءً من سنة 2020 ، حيث حل طفيل Blastocystissp. (60% من العينات الإيجابية( محل طفيل Entamoebahistolytica/dispar (25%). كان الأطفال الذين تتراوح أعمارهم بين 1 و 10 سنوات هم الفئة الأكثر تضرراً )متوسط 47 %(، بينما كان الرضع محميين نسبيا.ً انخفضت الأشكال المختلطة )الكيسية والنشطة( بعد سنة 2019 من 50 % إلى 30 % سنة 2025 ، مما يشير إلى عدوى أقل نشاطا لكن مع استمرار قابلية العدوى عبر الأكياس. لوحظ اشتباه في ظهور طفيل Cryptosporidium سنة 2025 . في مجال البكتيريا، بلغ معدل الإيجابية الإجمالي 10.7 %، مع استقرار النسبة بين عامي 2019 و 2022 )بين 9.1 % و 10.8 %(. سجل الرضع أقل من سنتين أعلى نسبة إيجابية ) 20.6 %، أي 2.2 ضعف المعدل العام(. ارتبط الوسط الداخلي بخطر أعلى مقارنة بالوسط الخارجي ) 12.5 % مقابل 8.9 %، خطر نسبي = 1.40 ؛ p = 0.0013). كانت بكتيريا Escherichia coli هي الأكثر انتشاراً بنسبة 71 %. الإشارة التحذيرية الأهم هي ظهور بكتيريا Klebsiellapneumoniae ابتداءً من سنة 2022 )من 0% إلى 14 % من العينات الإيجابية بين 2023 و 2024 (، مع تسجيل 90 % من الحالات في الوسط الداخلي (p = 0.045). لم يُلاحظ أي فرق ذو دلالة إحصائية حسب الجنس في الدراسة البكتيرية، على عكس الدراسة الطفيلية حيث كان الرجال أكثر تضرراً )فارق متوسط قدره 4.3 نقطة مئوية(. في الختام، تظُهر هذه الدراسة أن الالتهابات الهضمية لا تزال منتشرة بشكل كبير في منطقة غيليزان، مع تأثير عابر لتدابير كوفيد- 19 ، وهشاشة متمايزة لدى فئة الأطفال )الرضع بالنسبة للبكتيريا، والأطفال الأكبر سنا بالنسبة للطفيليات(، وظهور مقلق لبكتيريا Klebsiellapneumoniae في الوسط الداخلي. الأولويات العملية المستخلصة هي تعزيز تدابير النظافة في المؤسسات المغلقة، وتنفيذ برنامج سنوي لإزالة الديدان في المدارس، وإجراء اختبارات حساسية المضادات الحيوية بشكل منهجي عند عزل Klebsiella ، وإدخال تقنيات محددة (Ziehl-Neelsen ، PCR) للكشف عن Cryptosporidium. Résumé Cette étude rétrospective menée dans un laboratoire hospitalier de la région de Relizane (Algérie) entre 2019 et 2025 avait pour objectif d’analyser et de comparer l’évolution des infections parasitaires intestinales et des infections à entérobactéries, en tenant compte de l’impact de la pandémie de COVID-19. En parasitologie, la prévalence globale a varié de 35 % à 51 %, avec un pic à 51 % en 2023 et un creux à 38 % en 2020 pendant les mesures sanitaires. Une inversion épidémiologique majeure a été observée à partir de 2020 : Blastocystissp. (60 % des positifs) a supplanté Entamoebahistolytica/dispar (25 %). Les enfants de 1 à 10 ans étaient le groupe le plus touché (47 % en moyenne), tandis que les nourrissons étaient relativement protégés. Les formes mixtes (kystiques et végétatives) ont diminué après 2019, passant de 50 % à 30 % en 2025, indiquant des infections moins souvent actives mais une persistance de la contagiosité kystique. Une suspicion d’émergence de Cryptosporidium a été notée en 2025. En bactériologie, le taux de positivité global était de 10,7 %, stable entre 2019 et 2022 (9,1 % à 10,8 %). Les nourrissons de moins de 2 ans présentaient le taux le plus élevé (20,6 %, soit 2,2 fois la moyenne). Le milieu interne était associé à un sur-risque significatif par rapport au milieu externe (12,5 % contre 8,9 %, risque relatif = 1,40 ; p = 0,0013). Escherichia coli dominait très largement (71 % des prélèvements positifs). Le signal d’alerte majeur est l’émergence de Klebsiellapneumoniae à partir de 2022 (0 % → 14 % des positifs en 2023-2024), avec 90 % des cas en milieu interne (p = 0,045). Aucune différence significative n’a été observée selon le sexe en bactériologie, contrairement à la parasitologie où les hommes étaient plus touchés (écart moyen de 4,3 points). L’absence de saisonnalité en bactériologie contraste avec une légère augmentation automnale des prélèvements parasitaires chez les enfants. En conclusion, cette étude montre que les infections digestives restent très prévalentes dans la région de Relizane, avec un impact transitoire des mesures COVID-19, une vulnérabilité pédiatrique différenciée (nourrissons pour les bactéries, enfants pour les parasites) et une émergence préoccupante de Klebsiellapneumoniae en milieu interne. Les priorités opérationnelles sont le renforcement des mesures d’hygiène dans les institutions fermées, la mise en place d’un déparasitage scolaire annuel, la réalisation systématique d’antibiogrammes pour Klebsiella, et l’introduction de techniques spécifiques (Ziehl-Neelsen, PCR) pour la détection de Cryptosporidium. ABSTRACT This retrospective study was conducted in a hospital laboratory in the Relizane region (Algeria) between 2019 and 2025 to analyze and compare the evolution of intestinal parasitic infections and Enterobacteriaceae infections, taking into account the impact of the COVID-19 pandemic. In parasitology, overall prevalence ranged from 35 % to 51 %, with a peak of 51 % in 2023 and a low of 38 % in 2020 during health restrictions. A major epidemiological shift occurred from 2020 onward: Blastocystis sp. (60 % of positive samples) replaced Entamoebahistolytica/dispar (25 %). Children aged 1–10 years were the most affected group (mean 47 %), while infants were relatively protected. Mixed forms (cystic and vegetative) decreased after 2019 from 50 % to 30 % in 2025, indicating less frequently active infections but persistent cystic contagiousness. A suspected emergence of Cryptosporidium was noted in 2025. In bacteriology, the overall positivity rate was 10.7 %, stable between 2019 and 2022 (9.1 % to 10.8 %). Infants under 2 years of age had the highest rate (20.6 %, i.e., 2.2 times the average). Institutional settings were associated with a significantly higher risk compared to community settings (12.5 % vs. 8.9 %, relative risk = 1.40; p = 0.0013). Escherichia coli largely dominated (71 % of positive samples). The major warning signal is the emergence of Klebsiellapneumoniae from 2022 (0 % → 14 % of positive samples in 2023–2024), with 90 % of cases in institutional settings (p = 0.045). No significant sex difference was observed in bacteriology, in contrast to parasitology where males were more affected (mean difference of 4.3 percentage points). The absence of seasonality in bacteriology contrasts with a slight autumn increase in parasitic samples in children. In conclusion, this study shows that digestive infections remain highly prevalent in the Relizane region, with a transient impact of COVID-19 measures, differentiated pediatric vulnerability (infants for bacteria, children for parasites), and a concerning emergence of Klebsiellapneumoniae in institutional settings. Operational priorities include strengthening hygiene measures in closed institutions, implementing annual school-based deworming, systematically performing antibiotic susceptibility testing for Klebsiella, and introducing specific techniques (Ziehl-Neelsen, PCR) for Cryptosporidium detection.
Description: Remerciement Dédicace Résumé Liste d’abréviations Liste des figures Liste des tableaux SOMMAIRE Introduction générale 1 Chapitre I : Synthèse bibliographique 2 1. Concepts de base sur les organismes parasites 3 1.1. Qu'est-ce qu'un parasite ? 3 1.2. Le parasitisme comme stratégie de survie 3 1.3. Catégories de parasitisme selon le mode de vie 3 1.3.1. Parasitisme facultatif 3 1.3.2. Parasitisme obligatoire 3 1.3.3. Parasitisme accidentel 3 1.3.4. Parasitisme opportuniste 3 1.3.5. Parasitisme intermittent 3 1.4. Diversité du monde parasitaire 3 1.4.1. Aspects morphologiques 3 1.4.2. Aspects biologiques 3 1.4.3. Localisation dans l'organisme hôte 3 1.4.4. Spécificité d'hôte 3 1.5. Types d'interactions hôte-parasite 3 1.5.1. Mutualisme 3 1.5.2. Commensalisme 4 1.5.3. Parasitisme 4 1.6. Cycles évolutifs chez les parasites 4 1.6.1. Cycle direct court 4 1.6.2. Cycle direct long 4 1.6.3. Cycle indirect 4 1.6.4. Localisation sur ou dans l'hôte 4 1.6.5. Rôles des différents hôtes 4 1.7. Voies de transmission des parasites à l'homme 4 1.7.1. Voie orale 4 1.7.2. Pénétration transcutanée 4 1.7.3. Voie sexuelle 4 1.7.4. Transmission transfusionnelle ou par greffe 4 1.7.5. Autres voies inhabituelles 4 1.8. Classification taxonomique des parasites d'intérêt médical 4 1.8.1. Les protozoaires 4 1.8.2. Les helminthes 5 2. Principales parasitoses liées à l'alimentation et à l'eau 5 2.1. Maladies parasitaires d'origine hydrique 5 3. Parasitoses transmises par la viande 6 3.1. La sarcocystose 6 3.1.1. Agent pathogène 6 3.1.2. Cycle biologique 6 3.1.3. Manifestations cliniques 6 3.1.4. Prévention 6 4. Parasitoses transmises par les végétaux 6 4.1. La fasciolose à Fasciolahepatica 6 4.1.1. Agent pathogène 6 4.1.2. Épidémiologie 6 4.1.3. Signes cliniques 6 4.1.4. Diagnostic 6 4.1.5. Traitement et contrôle 6 Partie I : La Leishmaniose Cutanée (Maladie Principale) 7 1. Généralités et définition 7 2. Répartition géographique 7 2.1. Dans l'Ancien Monde 7 2.2. Dans le Nouveau Monde 7 2.3. Situation en Algérie 7 3. Aspect clinique 7 4. Le parasite : Leishmania 7 4.1. Classification 7 4.2. Morphologie (Formes Promastigote et Amastigote) 7 4.3. Cycle évolutif 7 5. Le vecteur : le phlébotome 8 5.1. Classification et répartition 8 5.2. Morphologie 8 5.3. Cycle biologique 8 6. Le Réservoir : Les Rongeurs 8 7. Facteurs de Risque de Transmission 8 7.1. Facteurs Anthropiques (liés à l'Homme) 8 7.2. Facteurs Environnementaux Naturels 8 8. Méthode d'Isolement et Diagnostic 8 9. Mode de transmission 9 Partie II : Les Maladies Secondaires (Parasitoses Digestives) 9 1. Amibiase (Dysenterie amibienne) 9 1.1. Agent et Répartition 9 1.2. Morphologie, Biologie et Transmission 9 1.3. Clinique 9 2. Lambliase (Giardiase) 9 2.1. Agent et répartition 9 2.2. Morphologie, biologie et transmission 9 2.3. Clinique 9 3. Oxyurose 9 3.1. Agent et Répartition 9 3.2. Biologie, Transmission et Clinique 9 3.3. Diagnostic (Test de Scotch) 9 4.Tæniasis (Ténia) 9 4.1. Agent et Répartition 9 4.2. Morphologie, Cycle et Transmission 9 4.3. Clinique 9 Partie III : Le Paludisme (Maladie Rare mais à Risque) 10 1. Généralités et Agent Pathogène 10 2. Le vecteur : l'anophèle 10 2.1. Classification et morphologie 10 2.2. Cycle de vie et facteurs de transmission 10 3. Cycle évolutif du Parasite 10 3.1 Cycle asexué (Chez l'Homme) 10 3.2. Cycle sexué (Chez le Moustique) 10 4. Diagnostic Microscopique 10 4.1. Techniques de préparation (Goutte épaisse et Frottis) 10 4.2. Coloration et identification 10 5. Mesures de Prévention et Sensibilisation 10 5.1. Protection individuelle 10 5.2. Protection collective 10 5.3. Information 11 6. Synthèse des principaux agents pathogènes digestifs d'intérêt local 11 6.1. Généralités sur les infections digestives 11 6.2. Les protozoaires intestinaux : diversité et pathogénie 11 6.2.1. Entamoebahistolytica (amibiase) 11 6.2.2. Giardia intestinalis (giardiase ou lambliase) 11 6.2.3. Blastocystissp (statut controversé) 12 6.2.4. cryptosporidiumsp (parasite émergent) 13 6.3. Les helminthes intestinaux :diversité et impact nutritionnel 14 6.3.1. Enterobuisvermicularis (oxyurose) 14 6.3.2. Taeniasaginata (teaniasis) 15 6.3.3. Ascaris lumbricoides (ascaridiose) 16 6.4. Les entérobactéries pathogènes : infections bactériennes digestives et urinaires 17 6.4.1. Escherichia coli : le germe de loin le plus fréquent 17 6.4.2. Klebseillapneumoniae : une émergence préoccupante 18 6.4.3. Proteussp et Enterobactersp : autres entérobactéries fréquentes 19 6.5. Mécanismes d'acquisition des résistances bactériennes 19 6.6. Enjeux de santé publique et perspectives 20 1. Renforcement du système de surveillance épidémiologique 20 2. Amélioration des capacités diagnostiques des laboratoires 20 3. Lutte contre l'antibiorésistance 20 4. Déparasitage de masse en milieu scolaire 20 5. Amélioration de l'accès àl'eau potable et à l'assainissement 20 6. Recherche clinique et épidémiologique 20 Chapitre 2 : Matériels et Méthodes 22 1. Type et nature de l’étude1 23 2. Période et lieu de l’étude 23 3. Période de l’étude 23 4. Source et nature des données 23 5. Population d’étude 24 6. TECHNIQUES DE LABORATOIRE 24 6.1. Examen parasitologiquedes selles (EPS) 24 6.2. Test de Scotch pour l'oxyurose 25 6.3. Coproculture (bactériologie) 25 6.4. Examen cytobactériologique des urines (ECBU) 25 7. Variables étudiées 25 8. Démarches et méthodes statistiques 26 8.1. Analyse descriptives 26 8.2. Analyses graphiques 26 Chapitre 3: Résultats et Discussion 27 1. RESULTATS DE L'ÉTUDE PARASITOLOGIQUE 28 1.1. Aperçu général (2019-2025) 28 1.2. Distribution selon le sexe 28 1.3. Distribution selon l'âge 29 1.4. Types de parasites et inversion épidémiologique 30 1.5. Formes parasitaires (activité infectieuse) 30 2. RÉSULTATS DE L'ÉTUDEBACTERIOLOGIQUE 31 2.1. Taux global et évolution annuelle 31 2.2. Saisonnalité 32 2.3. Distribution selon le sexe 32 2.4. Distribution selon l'âge 33 2.5. Distribution selon le lieu de prélèvement 34 2.6. Fréquence des bactéries isolées 34 2.7.Émergance de Klebsiellapneumoniae(signald'alerte) 35 3. DISCUSSION 36 3.1. Impact de la pandémie de COVID-19 sur les infections digestives 36 3.2. Vulnérabilité des populations pédiatriques : un contraste instructif 37 3.3. Le sur-risque en milieu interne (bactériologie) 37 3.4. Inversion épidémiologique en parasitologie 38 3.5.Émergencede Klebiellapneumoniae :un signal d alerte majeur 38 3.6. Suspicion d'émergence de Cryptosporiduimen parasitologie 38 4. CONCLUSION GÉNÉRALE 41 1. Impact de la pandémie de COVID-19 41 2. Vulnérabilités pédiatriques différenciées 41 3. Sur-risque en milieu interne (bactériologie) 41 4. Signal d'alerte commun 41 5. Différence selon le sexe 41 6. Perspectives de recherche 41 Références 42
URI: http://dspace.univ-relizane.dz/home/handle/123456789/1025
ISSN: 2025/2026
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